Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrr3B2RXA8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabrr3B2RXA8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabrr3B2RXA8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrr3B2RXA8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms