Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Abcc8B2RUS7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Abcc8B2RUS7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms