Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usf3B2RUQ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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