Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtprbB2RU80 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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