Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apol7aB2RT54 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms