Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms