Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms