Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc2B2RR83 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms