Protein–RNA interactions for Protein: B2KFW1

Zscan20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan20B2KFW1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zscan20B2KFW1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan20B2KFW1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms