Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms