Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms