Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd5B1AYB6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mbd5B1AYB6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mbd5B1AYB6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms