Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfx1B1AY10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfx1B1AY10 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms