Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms