Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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