Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2c2A7L9Z8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2c2A7L9Z8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms