Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gbp4A4UUI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms