Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc9bA3KGF9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms