Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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