Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms