Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scn3aA2ASI5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scn3aA2ASI5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms