Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms