Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms