Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cavin4A2AMM0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cavin4A2AMM0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cavin4A2AMM0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cavin4A2AMM0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms