Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd1A2AKB4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd1A2AKB4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms