Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc183A2AJB1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms