Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprfA2A8L5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprfA2A8L5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprfA2A8L5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprfA2A8L5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms