Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm2A2A7B5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms