Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms