Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms