Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms