Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4921501E09RikA0A0R4J054 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms