Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms