Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Trbv5A0A0B4J1G9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv5A0A0B4J1G9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv5A0A0B4J1G9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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