Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms