Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv21A0A0A6YX06 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Trbv21A0A0A6YX06 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv21A0A0A6YX06 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv21A0A0A6YX06 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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