Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SGCZQ96LD1 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms