Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms