Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms