Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms