Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Robo3Q9Z2I4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms