Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms