Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccne2Q9Z238 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccne2Q9Z238 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms