Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms