Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rasgrp1Q9Z1S3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms