Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms