Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms