Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp5Q9Z131 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5Q9Z131 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms