Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sema4fQ9Z123 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sema4fQ9Z123 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms