Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skp2Q9Z0Z3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms